PDKもMTもボディは同じですので
ペダル側の穴位置がズレただけの全く同じ部品がMT用です
MTのペダル配置を見ると分かると思いますがPDKより右に寄ってます
ブレーキと位置が離れてしまいますが
その離れ具合は他社のAT車のレイアウトと変わりませんし
踵を付けたまま操作するには寧ろ自然な位置に来ます

慣れれば5分も掛からずに交換可能ですので、ディーラー入庫での指摘が気になるなら直ぐ元に戻せますよ