俺の祖父が若い頃に軍艦島で働いてたらしく、生前に話を聞いたことがある。あくまで民間レベルの話だけど、朝鮮人に対する差別はあったらしい。日本(特に長崎みたいな田舎)は村社会だから、よそ者をいじめる人はいるよ。
でも、それと世界遺産は別じゃないかな。もう戦前のことは政府として謝罪してるんだし、そもそも過去に差別があった場所が世界遺産に登録できないんだったら、他にも抹消しないといけなくなる世界遺産たくさんあるでしょ。