金剛先生が祈らなくなったのは壊れたわけではなく自分の意志であり
祈ると何らかのデメリットが発生するとかなのかな？

安直な発想だけど、祈るとインクルージョンの活動に影響が出て宝石達の記憶が消える・活動停止する→人間が消えて孤独がイヤな先生は祈るのを拒否したとか