そりゃそうだよ当たり前
下手にいじってメーカー保証を切られるのはサスペンション関連やエンジン周りなど
タイヤを他で変えたくらいで車の保証は切られないし切る根拠がない
タイヤ、ローター・パッド、バッテリーあたりは好きに変えてok
ただしバッテリーは交換後に車両データを上書きする必要があり、これは今では純正バッテリーでないと上書き不可になっている
MINI専門ショップでも対応のため結局はディーラーで変えるのと同じ手間がかかり、費用も変わらなくなっている（5万くらいか）