そもそもドゥークーもモールも元々敵だからな
オーダー66の対象にはならないだろうけど目の前にいたら捕獲または抹殺するでしょ

むしろプログラムで動いてるはずなのにジェダイ抜けたアソーカが襲われてる方が謎
元ジェダイも抹殺対象に入ってたのかな