256Gとか大容量化のせいでPCバックアップ時
容量を圧迫するのでローカルにAppを保存出来ない仕様にしたと思う
iPhoneに無いがPCには有るAppのアップデートを
PCでiTunesからは更新不可にしたのも容量対策ぽい

PCで使えないAppを貯め込まなくてもいいでしょ？
これからはiPhoneで全てDL出来るからやって下さい
PCに既にあるAppだけはD&DでiPhoneに移せますからねって事

App欄が消えたiTunes12.7とiOS11にして待つのは悪手
最後まで諦めずiOS10で粘るしかなさそう