んー
取り敢えず素人の俺でもできそうなこと書いておくわ
まず一旦pakタイプのModも含めて導入したModを移動して消す
win64内を一旦Mod導入前の状態に戻す
バニラの状態でクラッシュしないか起動テストする
3.0.0の解凍した中身をwin64内に入れる(当然わかってると思うけど中身のファイルだけをwin64直下に入れる)
>>89これをやる
Modをまだ入れずに起動テストする
Modの最新版が無いかNexusを確認する
余り影響が無いであろうpakタイプのModを入れて起動と動作テストする
他のModを一個ずつ入れて起動テストする

これで問題の切り分けができるはず