DS関係なくキーボード操作がガチャガチャになるとたまにしゃがみっぱなしになる事はあったな
しゃがみ操作を何度か繰り返すと直ったりしてたような

操作の仕方を見直すかもしゲーム用でないキーボードでプレイしてるなら新調することを考えてみては？
普通のキーボードは同時に押せるキーが3つ以下だったりしてそのせいもあるかもしれない