メニュー開くとパッドで動かせるカーソルが出るからそれを動かしてやりたいボタンの上でAボタンを押すといいよ
modの装備は装備したいmodにカーソルを合わせてAボタン押しっぱなしにして上のスロットまで持っていってAボタンを放す
要はマウスのドラッグ&ドロップと同じ要領で出来るよ