そのとおりなんですけど、hvのある車種にphvを設定すると価値が低くなるのは確かです。
phvの8割近くの燃費性能、装備をhvが持つから。
アメリカでは高速道路の優先レーン走行権利が付きますけれど日本ではそういうの無いですし。（愛知県と東京は5年くらい自動車税が免税になると思います）
プリウスphvだってあんま走ってないでしょう？