きちんとしたメーカーものならカバーもついてるし
バッテリーの真上に穴があってバッテリーに水が直接当たるとかそんな形状でもない限り問題視するほどでもない

NACAダクトは雨やゴミが入りにくい構造で無駄な空気抵抗もなくある意味完成された形状とは言われてる、ただ空気が通る量が少ないから大きな変化は望めない欠点


ちなみにカバーとは言うけど穴を塞ぐのではなくてラジエーター側に水を流してエンジンに直接雨水が当たらないようになってるモノもある、ラジエーターなら濡れてもきにすることはないでしょう
というか完全に穴塞いでプール状態になるようなダクトカバーなんて存在するのか?