一般的に言われる「ファビコン」とiOSの「お気に入りアイコン」は別のものだよ
お気に入りアイコンはAppleの独自実装で>>533の指定が必要

ファビコンの指定方法は標準化されてるけどAppleがずーっと無視してきた
けどiOS12とMojaveでやっと対応した
Safariで表示するには>>537をやればいい

そんだけの話