次に問題の金属部位破壊は本体にダメージを与えるか、だけど
この説は恐らく正しいっぽいです
正確には、達成度の部位破壊の項目を満たすと
その時点からエリア移動の条件である本体ダメージの下限値が緩くなる
という効果っぽい

追跡レベル6の状態でヘビィ氷結弾だけ胸に打ち続けるやり方で以下を調べた

クエ1回目 未破壊状態 → パージせず
クエ2回目 左右尻尾・左右後ろ足破壊 → パージせず
クエ3回目 頭・左右胸破壊 → パージせず
クエ4回目 右腕破壊 → パージせず
クエ5回目 左腕破壊 → パージ
クエ6回目 右後ろ足だけ破壊 → パージ
クエ7回目以降 とりあえず攻撃しとけばパージする

5回目のクエストで金属部位は全て破壊した状態になる
4回目は左腕だけ破壊してない状態
4回目はパージできず、5回目以降は全てパージできた
つまり、達成度を1回満たせば、総ダメージの条件が緩くなる
1回満たすだけでいいので、達成済みの部位を攻撃しても意味が無い
ということになる