開発者のやってるバックアップがこちら
バッチファイル自体は単純なので、コミュニティや2chを適当に検索すれば改良版が当たる

http://steamcommunity.com/app/381210/discussions/0/1843493219431981208/

cd c:\SteamBackup
del Profilesaves /q /a
rd Profilesaves
xcopy "C:\Program Files (x86)\Steam\userdata\IDNumber)\381210\remote" "C:\SteamBackup" /e

Then I created ProfileRestore.bat

xcopy "C:\SteamBackup" "C:\Program Files (x86)\Steam\userdata\(IdNUmber)\381210\remote" /e