税金自体は12/31の時点での損益合計で支払う

帳簿としては、円だろうがドルだろうがBTCだろうがETHだろうがLTCだろうが、
とにかく別の通貨、仮想通貨に交換した時点で、
それまで手元にあった通貨のキャピタルゲインを確定させ、記帳する。